MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 89164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019793	CAGGA	2	10	12	21	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019793	CTG	2	6	87	92	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019793	CAC	2	6	107	112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_019793	CAA	2	6	118	123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019793	A	6	6	144	149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019793	GCG	4	12	217	228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217736
7	NC_019793	GTC	2	6	316	321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217736
8	NC_019793	TTCT	2	8	391	398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019793	CGG	2	6	452	457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019793	ATCCTG	2	12	586	597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429217737
11	NC_019793	CAT	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217737
12	NC_019793	CTCA	2	8	691	698	25 %	25 %	0 %	50 %	429217737
13	NC_019793	TGA	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429217737
14	NC_019793	CACG	2	8	811	818	25 %	0 %	25 %	50 %	429217737
15	NC_019793	AC	3	6	834	839	50 %	0 %	0 %	50 %	429217737
16	NC_019793	GAACA	2	10	925	934	60 %	0 %	20 %	20 %	429217737
17	NC_019793	CCT	2	6	972	977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217737
18	NC_019793	CGC	2	6	1039	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217737
19	NC_019793	TCC	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217737
20	NC_019793	GGCG	2	8	1065	1072	0 %	0 %	75 %	25 %	429217737
21	NC_019793	C	6	6	1138	1143	0 %	0 %	0 %	100 %	429217737
22	NC_019793	CG	3	6	1219	1224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019793	ACG	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019793	GCA	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019793	AGC	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217738
26	NC_019793	CTG	2	6	1403	1408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217738
27	NC_019793	ACG	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217738
28	NC_019793	GAG	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217738
29	NC_019793	TCG	2	6	1576	1581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217738
30	NC_019793	GAG	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217738
31	NC_019793	TGG	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217738
32	NC_019793	GTCG	2	8	1840	1847	0 %	25 %	50 %	25 %	429217738
33	NC_019793	ACG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217739
34	NC_019793	TGC	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217739
35	NC_019793	GC	3	6	1944	1949	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
36	NC_019793	CTGG	2	8	1950	1957	0 %	25 %	50 %	25 %	429217739
37	NC_019793	GCC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217739
38	NC_019793	CTG	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217739
39	NC_019793	CTC	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217739
40	NC_019793	CCCA	2	8	2074	2081	25 %	0 %	0 %	75 %	429217739
41	NC_019793	GCC	2	6	2108	2113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217739
42	NC_019793	GAA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429217739
43	NC_019793	CCG	2	6	2180	2185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217739
44	NC_019793	GAC	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217739
45	NC_019793	GC	3	6	2254	2259	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
46	NC_019793	GCG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217739
47	NC_019793	GC	3	6	2299	2304	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
48	NC_019793	GC	3	6	2331	2336	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
49	NC_019793	CG	3	6	2433	2438	0 %	0 %	50 %	50 %	429217739
50	NC_019793	GCG	2	6	2462	2467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217739
51	NC_019793	CGG	2	6	2573	2578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019793	ACG	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019793	TAA	2	6	2712	2717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019793	CCG	2	6	2779	2784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_019793	TCA	2	6	2816	2821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019793	GCG	2	6	2822	2827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019793	CGG	3	9	2829	2837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019793	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019793	CAG	3	9	2933	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019793	CCG	2	6	2956	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019793	ACC	2	6	2997	3002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_019793	GAA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019793	CTT	2	6	3314	3319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019793	ATCC	2	8	3335	3342	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019793	CTG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019793	CT	3	6	3400	3405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019793	AAGCG	2	10	3537	3546	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019793	CAG	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019793	AAAC	2	8	3605	3612	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019793	ACG	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
71	NC_019793	CTG	3	9	3801	3809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217740
72	NC_019793	GCA	2	6	3834	3839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
73	NC_019793	ACG	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
74	NC_019793	CCG	2	6	3979	3984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
75	NC_019793	CTG	2	6	4029	4034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217740
76	NC_019793	CAT	2	6	4037	4042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
77	NC_019793	GGCGT	2	10	4056	4065	0 %	20 %	60 %	20 %	429217740
78	NC_019793	CGC	2	6	4272	4277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
79	NC_019793	AAC	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217740
80	NC_019793	TCG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217740
81	NC_019793	GCC	2	6	4370	4375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
82	NC_019793	GC	3	6	4387	4392	0 %	0 %	50 %	50 %	429217740
83	NC_019793	GTG	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217740
84	NC_019793	GTG	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217740
85	NC_019793	ATC	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
86	NC_019793	GAG	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217740
87	NC_019793	GCGG	2	8	4536	4543	0 %	0 %	75 %	25 %	429217740
88	NC_019793	CGC	2	6	4562	4567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
89	NC_019793	AGCC	2	8	4579	4586	25 %	0 %	25 %	50 %	429217740
90	NC_019793	CGA	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
91	NC_019793	ACC	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217740
92	NC_019793	CGC	2	6	4658	4663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
93	NC_019793	GCG	2	6	4670	4675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
94	NC_019793	GAG	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217740
95	NC_019793	CAC	2	6	4758	4763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217740
96	NC_019793	GCG	2	6	4782	4787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
97	NC_019793	CGA	2	6	4862	4867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
98	NC_019793	GAC	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
99	NC_019793	TCA	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
100	NC_019793	GGC	2	6	4980	4985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
101	NC_019793	GCG	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
102	NC_019793	GC	3	6	5097	5102	0 %	0 %	50 %	50 %	429217740
103	NC_019793	GGC	2	6	5112	5117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
104	NC_019793	CCT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217740
105	NC_019793	GCC	2	6	5317	5322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
106	NC_019793	CGA	2	6	5366	5371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
107	NC_019793	ACA	2	6	5398	5403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217740
108	NC_019793	CGA	2	6	5420	5425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
109	NC_019793	GCC	2	6	5428	5433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
110	NC_019793	CCG	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
111	NC_019793	TCA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429217740
112	NC_019793	CCGGCC	2	12	5509	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
113	NC_019793	GAC	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
114	NC_019793	TC	3	6	5619	5624	0 %	50 %	0 %	50 %	429217740
115	NC_019793	CGA	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217740
116	NC_019793	GCTC	2	8	5681	5688	0 %	25 %	25 %	50 %	429217740
117	NC_019793	GCC	2	6	5782	5787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217740
118	NC_019793	CGCTGG	2	12	5824	5835	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429217740
119	NC_019793	GGACA	2	10	5880	5889	40 %	0 %	40 %	20 %	429217740
120	NC_019793	CGAG	2	8	5900	5907	25 %	0 %	50 %	25 %	429217740
121	NC_019793	GGC	2	6	5912	5917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217740
122	NC_019793	ACC	2	6	5918	5923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429217740
123	NC_019793	AAC	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217740
124	NC_019793	ACAG	2	8	6010	6017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019793	TCCT	2	8	6037	6044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019793	CG	3	6	6057	6062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019793	GCC	2	6	6119	6124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217741
128	NC_019793	GCG	2	6	6203	6208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
129	NC_019793	GCG	2	6	6213	6218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
130	NC_019793	GGC	2	6	6236	6241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
131	NC_019793	GCG	2	6	6268	6273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
132	NC_019793	GAG	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217741
133	NC_019793	GCG	2	6	6324	6329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
134	NC_019793	CGG	2	6	6358	6363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217741
135	NC_019793	GCT	3	9	6388	6396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217741
136	NC_019793	CGCGCT	2	12	6409	6420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	429217741
137	NC_019793	GAG	2	6	6452	6457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217741
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139	NC_019793	CG	3	6	6528	6533	0 %	0 %	50 %	50 %	429217741
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251	NC_019793	AGG	2	6	11915	11920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_019793	CTC	2	6	12112	12117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429217745
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259	NC_019793	CGA	2	6	12265	12270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217745
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261	NC_019793	CAA	2	6	12304	12309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429217745
262	NC_019793	AGG	2	6	12423	12428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429217745
263	NC_019793	GTG	3	9	12457	12465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429217746
264	NC_019793	GCC	2	6	12502	12507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217746
265	NC_019793	TGC	2	6	12515	12520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217746
266	NC_019793	TGC	2	6	12527	12532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217746
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268	NC_019793	CGG	2	6	12561	12566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217746
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397	NC_019793	CG	3	6	17806	17811	0 %	0 %	50 %	50 %	429217750
398	NC_019793	CGA	2	6	17818	17823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217750
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401	NC_019793	GC	3	6	17956	17961	0 %	0 %	50 %	50 %	429217750
402	NC_019793	CTCG	2	8	17971	17978	0 %	25 %	25 %	50 %	429217750
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440	NC_019793	GGCGG	2	10	19784	19793	0 %	0 %	80 %	20 %	429217752
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444	NC_019793	GC	4	8	19912	19919	0 %	0 %	50 %	50 %	429217753
445	NC_019793	GC	3	6	19936	19941	0 %	0 %	50 %	50 %	429217753
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452	NC_019793	CGG	2	6	20302	20307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217753
453	NC_019793	ACG	2	6	20328	20333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217753
454	NC_019793	GGGC	2	8	20382	20389	0 %	0 %	75 %	25 %	429217753
455	NC_019793	GCG	2	6	20451	20456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429217753
456	NC_019793	GCC	2	6	20531	20536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217753
457	NC_019793	GCC	2	6	20561	20566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429217753
458	NC_019793	GC	4	8	20575	20582	0 %	0 %	50 %	50 %	429217753
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460	NC_019793	GCT	2	6	20590	20595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429217753
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464	NC_019793	GAC	2	6	20741	20746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429217753
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466	NC_019793	TCT	2	6	20775	20780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429217753
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470	NC_019793	TGA	2	6	20847	20852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429217753
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488	NC_019793	GGA	2	6	21559	21564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
489	NC_019793	TCC	2	6	21576	21581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
490	NC_019793	GC	3	6	21794	21799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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492	NC_019793	GAT	2	6	21828	21833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
493	NC_019793	TCT	2	6	21920	21925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
494	NC_019793	CAT	2	6	21968	21973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
495	NC_019793	CGG	2	6	22019	22024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
496	NC_019793	GC	3	6	22145	22150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_019793	CGT	2	6	22160	22165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
498	NC_019793	GC	4	8	22166	22173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_019793	GAG	2	6	22206	22211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_019793	CTG	2	6	22248	22253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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